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聽(tīng)課筆記 | 第九屆李曼中國(guó)養(yǎng)豬大會(huì)主論壇(15日下午分會(huì) 三場(chǎng)合輯)

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分會(huì)1-----疾病防控
2020年10月15日下午

2020年10月15日,第九屆李曼中國(guó)養(yǎng)豬大會(huì)分會(huì)1----疾病防控在重慶悅來(lái)國(guó)際會(huì)議中心舉行。本次大會(huì)由新希望六和首席科學(xué)家閆之春,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)周銳博士主持。

分會(huì)一:疾病防控

01、
中國(guó)養(yǎng)豬業(yè)健康管理的變遷之路
樊福好,農(nóng)業(yè)農(nóng)村部種豬質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)測(cè)試中心(廣州)

政策的變遷
定點(diǎn)清除
官方檢測(cè)
鼓勵(lì)養(yǎng)殖
自主檢測(cè)
三公里撲殺(已經(jīng)改變)

選址
高地、干燥

免疫
減少了部分常規(guī)免疫

消毒方式多樣
復(fù)方過(guò)氧一硫酸鉀
過(guò)氧乙酸
戊二醛
苛性鈉
碘制品
電解水
紫外線

通風(fēng)方式
更傾向于垂直通風(fēng)
料槽
從通槽到單體槽

采樣和檢測(cè)
口腔液得到更多的應(yīng)用

飼料加工方式:高溫制粒,熟化

營(yíng)養(yǎng)需求
營(yíng)養(yǎng)冗余

關(guān)鍵技術(shù)
單元格化技術(shù)
唾液檢測(cè)技術(shù)
生物隔離技術(shù)
熱化處理技術(shù)
營(yíng)養(yǎng)冗余技術(shù)

02、
豬偽狂犬病的綜合防治與凈化
吳斌,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)


1、豬偽狂犬病的特點(diǎn)
  • PRV的免疫學(xué)特點(diǎn):體液免疫、細(xì)胞免疫、局部免疫;免疫保護(hù)期
  • PRV的流行病學(xué)特點(diǎn):多種動(dòng)物可感染或帶毒;
    可建立潛伏感染并間斷性排毒;
  • 豬感染后的臨床特點(diǎn):仔豬;保育豬;生長(zhǎng)育肥豬;
    種豬(公豬、妊娠母豬、哺乳母豬、后備種豬)

2、偽狂犬病在中國(guó)的兩次大流行

3、病毒分子流行病學(xué)
45株偽狂犬病病毒臨床毒株的全基因組重測(cè)序:
45株P(guān)RV基因組中存在較多的變異區(qū)域
PRV遺傳進(jìn)化分析顯示主要分為2個(gè)主要的基因型:
所有的中國(guó)分離株位于基因2型,而國(guó)外分離株全部位于基因1型。
PRV間存在較強(qiáng)的同源重組現(xiàn)象
  • 最新研究針對(duì)PRV感染人的病例,提出人偽狂犬病腦炎的定義,特征與診斷依據(jù)。
  • 2019年首次從患者腦脊液中分離得到一株P(guān)RV hSD-1/2019,為PRV向人群的跨種傳播提供了直接有力的病毒分離證據(jù)。
  • 生物學(xué)特性及基因組分析發(fā)現(xiàn),hSD-1/2019毒株與我國(guó)豬群中當(dāng)前流行的PRV變異毒株高度相似。

4、豬偽狂犬病的防控
建議免疫程序(依感染風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估調(diào)整)
  • 種豬:“3+2免疫程序” ,即一年普免3次活疫苗,每胎產(chǎn)前免疫滅活疫苗(首次滅活疫苗應(yīng)免疫2次,間隔4周);
  • 后備:配種前8周齡一次免活疫苗 ;配種前4周滅活苗加強(qiáng)免疫;產(chǎn)前4周滅活疫苗免疫,以后按生產(chǎn)母豬免疫程序。
  • 仔豬:“2+1+1免疫程序” 0日齡和45日齡活疫苗;90-95日齡滅活苗;(生產(chǎn)周期6-7月以上豬群在140日齡加強(qiáng)免疫一針活苗),種用豬120-130日齡免疫活苗。

5、豬偽狂犬病的防控
  • 用安全性高的基因缺失疫苗(推薦HB-98或2000株) 進(jìn)行基礎(chǔ)免疫
  • 結(jié)合滅活疫苗,進(jìn)行強(qiáng)化免疫,阻止感染和后備豬陽(yáng)轉(zhuǎn)
  • 凈化種豬群,每年公豬和后備豬應(yīng)為全陰性
    (豬只感染病毒將終身攜帶,成為該病傳染源)
  • 維持種群凈化,實(shí)現(xiàn)免疫無(wú)疫,探索非免疫無(wú)疫

6、豬偽狂犬病的凈化


7、豬偽狂犬病的凈化過(guò)程
準(zhǔn)備階段:
  • 根據(jù)豬場(chǎng)規(guī)模、豬群結(jié)構(gòu)和分布特點(diǎn),設(shè)計(jì)合理的采樣方案,對(duì)豬場(chǎng)進(jìn)行摸底調(diào)查,掌握?qǐng)鰞?nèi)偽狂犬病疫情狀況;
  • 評(píng)估豬群免疫保護(hù)水平(有條件采用中和抗體水平評(píng)價(jià)或細(xì)胞免疫水平評(píng)價(jià)),確定豬群的PRV gE轉(zhuǎn)陽(yáng)時(shí)間點(diǎn)與gB消長(zhǎng)規(guī)律;
  • 評(píng)估豬場(chǎng)現(xiàn)有的免疫方案, 針對(duì)不同的豬群進(jìn)行優(yōu)化改進(jìn), 確保較高的免疫保護(hù)率。
控制階段:
免疫-監(jiān)測(cè)
疫苗:含gE缺失的活疫苗和滅活疫苗 ;合理免疫程序;
監(jiān)測(cè):每半年進(jìn)行一次血清學(xué)和病原學(xué)檢查 ,抽樣比例5~ 8%;
  • 陰陽(yáng)性豬分群飼養(yǎng)
    當(dāng)gE陽(yáng)性豬比例下降到20%以下時(shí)開(kāi)始分群, 將血清學(xué)gE陽(yáng)性豬與陰性豬分開(kāi)飼養(yǎng);
  • 逐步淘汰和縮小陽(yáng)性豬群
  • 強(qiáng)化陰性群的隔離與監(jiān)測(cè), 建立完全健康的gE陰性豬群, 確保后備豬群陰性
  • 其它疫病的感染控制
強(qiáng)制凈化階段:
  • 對(duì)全群豬只進(jìn)行檢測(cè), 剔除全部陽(yáng)性豬只;
  • 剔除后建立的健康豬群于一個(gè)月后按10%比例抽樣復(fù)查, 無(wú)陽(yáng)性豬則三個(gè)月后按相同方法進(jìn)行復(fù)查,連續(xù)兩次為陰性者則每半年進(jìn)行一次血清學(xué)和病原學(xué)抽樣復(fù)查, 抽樣復(fù)查如有陽(yáng)性, 在陽(yáng)性率1%以內(nèi), 按剔除后建立的健康豬群方式進(jìn)行免疫和監(jiān)測(cè), 1%- 5%則重新進(jìn)行全群檢測(cè)剔除全部陽(yáng)性豬只;
  • 關(guān)鍵點(diǎn):公豬、 后備種豬
  • 哨兵豬設(shè)置

8、凈化的非技術(shù)性關(guān)鍵因素


03、我們從亞太地區(qū)非洲豬瘟形勢(shì)和防控行動(dòng)學(xué)到了什么
楊振,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)



背景
亞太人均豬肉消費(fèi)多,有明顯的豬肉飲食文化,全球豬肉產(chǎn)量大。

全球非洲豬瘟概況



亞太地區(qū)非洲豬瘟形勢(shì)

亞太地區(qū)非洲豬瘟防控國(guó)家案例
主要介紹和韓國(guó)和越南的非洲豬瘟案例


總結(jié)
非洲豬瘟疫情仍在亞太地區(qū)蔓延和反復(fù)
亞太國(guó)家的防非的重點(diǎn)因主要面臨的風(fēng)險(xiǎn)因素而不同,ASF在野豬和環(huán)境的防控難度大于常規(guī)豬場(chǎng)的防控和凈化;養(yǎng)豬價(jià)值鏈復(fù)雜的國(guó)家,防控難度大
疫情報(bào)告數(shù)據(jù)和流行病學(xué)調(diào)查和分享有利于發(fā)現(xiàn)風(fēng)險(xiǎn)因素和疫情變化規(guī)律
國(guó)家防控非洲豬瘟等跨境動(dòng)物傳染病成敗因素:政治意愿、養(yǎng)豬價(jià)值鏈復(fù)雜度、國(guó)家區(qū)位因素、養(yǎng)殖基礎(chǔ)信息、疫病防控設(shè)施、多部門合作水平、產(chǎn)業(yè)和政府之間的互信、動(dòng)物疫病應(yīng)急管理能力和專業(yè)人才隊(duì)伍。



分會(huì)2-----PED防控
2020年10月15日下午

2020年10月15日,第九屆李曼中國(guó)養(yǎng)豬大會(huì)分會(huì)2----PED防控在重慶悅來(lái)國(guó)際會(huì)議中心舉行。本次大會(huì)由哈爾濱獸醫(yī)研究所馮力博士主持。大會(huì)精彩筆記內(nèi)容如下:

01、成功的清潔和衛(wèi)生以防控制豬流行性腹瀉
克萊頓·約翰孫獸醫(yī)博士,迦太基獸醫(yī)服務(wù)有限公司



一、 豬流行性腹瀉是可防可控的
PED可以利用您現(xiàn)有的資源進(jìn)行預(yù)防和控制

二、 腹瀉防控的關(guān)鍵點(diǎn)
  • 理解的關(guān)鍵點(diǎn)
  • 工作量巨大
  • 初期成功率較低
  • 不能犯任何錯(cuò)誤
  • 我們有充足的人力和時(shí)間來(lái)完成工作
  • 清潔和消毒的有效方法很多
  • 沒(méi)有一個(gè)計(jì)劃適合每個(gè)農(nóng)場(chǎng)
  • 許多計(jì)劃都有可能奏效


三、 清潔和消毒
幾乎不可能對(duì)骯臟的表面進(jìn)行消毒
細(xì)菌產(chǎn)生的生物膜可以覆蓋在表面,用耐水的貝殼膠保護(hù)微生物,耐消毒,并能隨著時(shí)間的推移釋放出病原體
堿性清潔劑可以降解和皂化生物膜

四、 停工期
分娩室:最少需要兩晚
分娩室:最少需要兩晚
第一天:清潔、沖洗、干燥、消毒
石灰水清洗
裝載

保證養(yǎng)豬區(qū)域的清潔、溫度和空置
盡可能地保持房間的熱量
使用蠑螈式加熱器,從一個(gè)房間移動(dòng)到另一個(gè)房間
為養(yǎng)殖場(chǎng)的清潔區(qū)、檢查區(qū)、和核準(zhǔn)通過(guò)區(qū)準(zhǔn)備新的衣服和靴子
與之前使用過(guò)的衣服靴子不同顏色

02、豬病毒性腹瀉防控面臨的挑戰(zhàn)與對(duì)策
馮  力,哈爾濱獸醫(yī)和研究所


哈爾濱獸醫(yī)研究所的馮力研究員,給大家分享了豬病毒性腹瀉科學(xué)防控的難點(diǎn)、要點(diǎn)及主要誤區(qū)

豬病毒性腹瀉的基本知識(shí)

豬病毒性腹瀉的特點(diǎn):
主要以侵染消化道、導(dǎo)致豬只嘔吐、腹瀉、脫水和哺乳仔豬高死亡率的一類病毒性傳染病。
嘔吐,水樣腹瀉,脫水,哺乳仔豬的高死亡率
無(wú)體溫升高,瀕死期體溫降低
所有日齡豬只均可感染,日齡增加,死亡率下降
病原為病毒,具有極強(qiáng)的傳染性
冬春季節(jié)多發(fā),夏季發(fā)生也成“新常態(tài)”
抗菌素治療無(wú)效

豬病毒性腹瀉科學(xué)防控的難點(diǎn)
難點(diǎn)一:引起腹瀉的因素復(fù)雜
難點(diǎn)二:腹瀉病臨床上難以區(qū)分
難點(diǎn)三:多基因型(血清型)
難點(diǎn)四:新的病原的出現(xiàn)
難點(diǎn)五:抗原性的變異
難點(diǎn)六:病原的致病性弱,免疫源性差
難點(diǎn)七:混合感染導(dǎo)致病情更為嚴(yán)重
難點(diǎn)八:缺少最好的抗原遞呈途徑

科學(xué)防控豬病毒性腹瀉的四大要點(diǎn)
要點(diǎn)一:明確病因(正確的診斷)
要點(diǎn)二:科學(xué)的抗體檢測(cè)(監(jiān)測(cè))
要點(diǎn)三:科學(xué)免疫策略
要點(diǎn)四:完善的生物安全措施
防控的關(guān)鍵點(diǎn):
確定發(fā)病病原!確診。
做好全群免疫,不留易感豬群(尤其是做好后備母豬【初產(chǎn)母豬】,后備公豬的免疫)!
列入常規(guī)免疫計(jì)劃而非季節(jié)性免疫
抗體檢測(cè)(監(jiān)測(cè))在活疫苗免疫中非常重要!
嚴(yán)格的生物安全措施:多點(diǎn)飼養(yǎng),全進(jìn)全出,嚴(yán)格的消毒與空舍!
做好產(chǎn)子舍保溫!
避免應(yīng)激,提高機(jī)體自身抗病力

豬病毒性腹瀉的四大誤區(qū)

第一個(gè)是概念與觀念誤區(qū)
腹瀉不等于豬病毒性腹瀉
望文生義TGEV≠PEDV≠PDCV≠PoRV
病毒性腹瀉只有冬天發(fā)生
豬病毒性腹瀉只感染小豬,不感染大豬
豬病毒性的損失只在哺乳仔豬

第二個(gè)是診斷誤區(qū)
診斷想當(dāng)然,僅憑借臨床癥狀來(lái)判斷
一次實(shí)驗(yàn)室診斷結(jié)果用幾次或一兩年
實(shí)驗(yàn)室診斷不全面,只做PEDV檢測(cè)
不能區(qū)分疫苗毒與野毒
試驗(yàn)室檢測(cè)水平不同,結(jié)果的科學(xué)與真實(shí)無(wú)保證

第三個(gè)是疫苗免疫誤區(qū)
不當(dāng)傳染病對(duì)待,只是局部免疫(母豬免)
經(jīng)產(chǎn)與后備母豬一樣免疫
等到發(fā)病了,才接種疫苗,疫苗當(dāng)治療制劑
只有流行季節(jié)前做,平時(shí)基本不進(jìn)行免疫
過(guò)度依賴疫苗,不重視生物安全
反復(fù)返飼

第四個(gè)是生物安全誤區(qū)
不重視生物安全
做不到真正的全進(jìn)全出
消毒不徹底,空舍時(shí)間過(guò)短
不把引種、隔離當(dāng)回事
綜合管理出現(xiàn)漏洞

03、非洲豬瘟威脅下新建群病毒性腹瀉的防控
顏 忠,新希望六和養(yǎng)豬研究院

腹瀉病毒的基本生物學(xué)特性


屬于套式病毒目、冠狀病毒科、甲型冠狀病毒屬
RNA病毒,基因組大小28kb,
在4℃下可以在金屬上存活20天,在聚苯乙烯泡沫塑料、鋁、Tyvek®工作服、布和塑料上最多可以存活15天
pH <4和pH>9時(shí)病毒被完全滅活
一般性消毒藥均可滅活PEDV,如氧化劑(Virkon S),漂白劑, 2%氫氧化鈉
糞-口途徑是PEDV傳播的主要手段,無(wú)癥狀感染的大豬,能夠造成病毒的亞臨床傳播。

豬場(chǎng)PED感染狀態(tài)分類



豬場(chǎng)PED控制和根除策略



后備豬全群返飼馴化—激活粘膜免疫系統(tǒng)


在生產(chǎn)實(shí)踐中PED主要發(fā)生在初產(chǎn)母豬,PEDV感染對(duì)初產(chǎn)母豬生產(chǎn)性能的影響比經(jīng)產(chǎn)母豬更加嚴(yán)重,對(duì)生產(chǎn)性能的影響程度取決于感染的階段(Olanratmanee, 2010)
在入群之前使用對(duì)后備母豬進(jìn)行返飼誘導(dǎo)免疫力將是有利的。(Anchalee Srijangwad,2017)
妊娠母豬或待產(chǎn)后備豬通過(guò)強(qiáng)毒(感染新生仔豬腸道或其他感染性材料)暴露進(jìn)行PEDV馴化使母豬產(chǎn)生針對(duì) PEDV 的免疫保護(hù)(Niederwerder and Hesse, 2018)
激活后備豬的粘膜免疫系統(tǒng)的對(duì)于保護(hù)母豬腸道至關(guān)重要(Jung K, Saif 2015),通過(guò)腸-乳腺-sIgA 軸將抗體提供給仔豬,初乳/奶水中PEDV特異性sIgA抗體的水平是決定其仔豬抵抗PEDV感染的的關(guān)鍵(Langel et al., 2019a; Saif et al., 2012)
綜上所述,新建群對(duì)后備豬全群進(jìn)行PED統(tǒng)一馴化至關(guān)重要。

非洲豬瘟威脅下新建群PED防控難點(diǎn)
養(yǎng)豬企業(yè)進(jìn)行復(fù)產(chǎn)、擴(kuò)產(chǎn),三邊生產(chǎn)(邊發(fā)展、邊建設(shè)、邊生產(chǎn)),新場(chǎng)、新員工、新豬群,面臨各種復(fù)雜的問(wèn)題和挑戰(zhàn),
豬群來(lái)源不同的豬場(chǎng)、品種不一致,健康度不一致,免疫背景不一致,給混群帶來(lái)了極大的風(fēng)險(xiǎn),
過(guò)往的全群返飼馴化技術(shù)(使用腸道、糞便)操作難度大、病毒含量不確定、成本高、效果不確實(shí)并存在其他病原污染的風(fēng)險(xiǎn),ASF威脅下,這種風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)一步加大,
面對(duì)這些問(wèn)題,我們必須開(kāi)發(fā)出安全性高,抗原匹配度高、含量高、均一、成本低的產(chǎn)品(S蛋白亞單位疫苗、病毒分離純化等等)。

新建群PED防控新方法
(一)、新建廠生物安全升級(jí)及分區(qū)管理
(二)、變異毒株疫苗的應(yīng)用
(三)、新建群后備豬全群馴化新技術(shù)
1、PED微生態(tài)調(diào)節(jié)劑的研發(fā)2、馴化方案實(shí)施3、免疫器械的準(zhǔn)備4、飼喂方式5、監(jiān)測(cè)方案6、減毒方法7、關(guān)鍵點(diǎn)8、馴化效果評(píng)估--臨床表現(xiàn)數(shù)據(jù)分析

總結(jié)
1、科學(xué)的方法是取得PED防控勝利的最大法寶;
2、生物安全是防控PED的根本;
3、首次實(shí)現(xiàn)了新建群全群PED統(tǒng)一馴化,這種新方法安全高效、抗原匹配度高、含量高、劑量準(zhǔn)確、效果確實(shí)、成本低;
4、新建群引種結(jié)束之后,在距離分娩前2個(gè)月左右馴化1次,能夠?yàn)樽胸i提供高水平的IgA抗體,并保證足夠的排毒和減毒時(shí)間,對(duì)生產(chǎn)影響最??;
5、馴化后場(chǎng)內(nèi)病原凈化+初乳高水平IgA抗體水平是豬群維持穩(wěn)定的關(guān)鍵;
6、采集環(huán)境樣品可以作為定期監(jiān)測(cè)豬群和環(huán)境中PEDV活躍的一種方法;
7、可以采集口腔液和初乳用于監(jiān)測(cè)評(píng)估IgA抗體水平。



分會(huì)3-----診斷檢測(cè)
2020年10月15日下午

2020年10月15日,第九屆李曼中國(guó)養(yǎng)豬大會(huì)分會(huì)3----診斷檢測(cè)在重慶悅來(lái)國(guó)際會(huì)議中心舉行。本次大會(huì)由中國(guó)動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心獸醫(yī)學(xué)博士原霖主持。大會(huì)精彩筆記內(nèi)容如下:

01、使用診斷檢測(cè)的對(duì)與錯(cuò)
杰里·托里森   明尼蘇達(dá)大學(xué)


概要

簡(jiǎn)述: 診斷使用的不當(dāng)之處

1、使用過(guò)于寬泛的計(jì)劃

2、使用局限性太大的計(jì)劃

3、對(duì)實(shí)驗(yàn)室隱瞞信息

有效的診斷方法

1、有一個(gè)計(jì)劃好的診斷目標(biāo)

2、了解疾病動(dòng)態(tài)

3、了解測(cè)試能力


明確說(shuō)明診斷目標(biāo)

示例:
1. 我想用一個(gè)毒株來(lái)生產(chǎn)疫苗。
2. 我需要確定這個(gè)豬群沒(méi)有感染過(guò)豬肺炎支原體。
有限的診斷性調(diào)查僅提供有限的結(jié)果
“任何器官都不是一座孤島,也就是說(shuō),所有東西都是相互關(guān)聯(lián)的?!?/font>
          - 明尼蘇達(dá)大學(xué)獸醫(yī)診斷實(shí)驗(yàn)室,斯蒂芬妮·羅索博士
限制成功的診斷方法:
  • 我已經(jīng)知道有什么問(wèn)題了。
  • 我知道錯(cuò)出在哪里,并想證明這一點(diǎn)。

了解全面情況

呼吸系統(tǒng)疾病動(dòng)態(tài)

了解測(cè)試能力

樣本類型效應(yīng)
是否需要活病毒或細(xì)菌?
如果需要后續(xù)測(cè)試該怎么辦?
信息生成
是否有基線資料可供比較?
這是第一次診斷嘗試,還是需要測(cè)試之外的工作?
我將如何使用得到的測(cè)試結(jié)果?

02、診斷及控制保育期腹瀉
法比奧·萬(wàn)努奇   明尼蘇達(dá)大學(xué)

診斷及控制保育期腹瀉


腸毒素性大腸桿菌(ETEC)
防控:
  • 氧化鋅(1500-3000ppm)
-減少腹瀉、降低死亡率、提高性能(生長(zhǎng)和飼料轉(zhuǎn)化率)
-作用機(jī)制尚不完全清楚:粘膜完整抑制細(xì)菌黏附(?)
-環(huán)境問(wèn)題和共同抗藥性(四環(huán)素和磺胺類藥物)
  • 有機(jī)酸
-抑制微環(huán)境的酸化
-作用方式不明
-效力差異很大,結(jié)果相互矛盾
  • 免疫預(yù)防
-新生豬仔ETEC腹瀉:通過(guò)被動(dòng)的結(jié)腸/乳源性免疫來(lái)預(yù)防。
-斷奶后ETEC腹瀉:需要積極的腸道粘膜免疫反應(yīng)。
  • 肌肉注射:商用和自家
  • 口服 (非致病性表現(xiàn)菌毛,不產(chǎn)生腸毒素)
  • 亞單位口服:正在研發(fā)中,F(xiàn)4和F18免疫原性有差異
-不同菌毛間的交叉保護(hù)(?)

腸道沙門氏菌
  • 沙門氏菌腸道血清型傷寒桿菌
  • 沙門氏菌腸道血清型I 1,4,[5],12&#8201;:&#8201;i:‐
-新出現(xiàn)的傷寒桿菌血清型變體
-近年來(lái)美國(guó)豬沙門氏菌病的臨床主要病因
  • 無(wú)法區(qū)分的臨床表現(xiàn)
-持續(xù)5-7天水樣腹瀉(零星血跡)
-脫水,以及整個(gè)保育-育肥階段表現(xiàn)不佳

未來(lái)的挑戰(zhàn):對(duì)抗菌素使用的限制
歐洲經(jīng)驗(yàn):疾病發(fā)生率(禁止使用抗菌素作為生長(zhǎng)促進(jìn)劑之前及之后對(duì)比)
  • 腹瀉顯著增加(保育)
-斷奶后腹瀉:β-溶血性大腸桿菌
-螺旋體結(jié)腸炎
-臨床回腸炎(細(xì)胞內(nèi)勞森菌
  • 規(guī)模很關(guān)鍵
  • 管理及其他替代策略
  • 豬呼吸道疾病綜合征(PRDC)
-成功控制原發(fā)性誘發(fā)因素:接種疫苗、消滅病毒
  • 豬腸道疾病綜合征(PEDC) ???
-腸道細(xì)菌是主要原因
-協(xié)同作用:輪狀病毒、大腸桿菌(?)
  • 微生物組的復(fù)雜性
三代測(cè)序技術(shù)基本原理
準(zhǔn)確度:?jiǎn)螚l序列的準(zhǔn)確率約85%,拼接后可達(dá)99%,準(zhǔn)確度低于二代測(cè)序和一代測(cè)序;
測(cè)序長(zhǎng)度:?jiǎn)味藥装賐p-幾M,長(zhǎng)度最長(zhǎng);
測(cè)序成本:目前比二代和一代測(cè)序成本高;
測(cè)序通量:可達(dá)數(shù)百萬(wàn)條以上片段,幾十G-幾T的數(shù)據(jù)量;
PCR:無(wú)需PCR,直接測(cè)序。
數(shù)據(jù)分析:要求高,需要專業(yè)的生物信息學(xué)分析工具。
其他:可進(jìn)行RNA直接測(cè)序,Nanopore的minion測(cè)序儀可以做到隨身攜帶。
Nanopore的Minion便攜式測(cè)序儀是第一款普通實(shí)驗(yàn)室都可以配置的測(cè)序儀,也使得測(cè)序技術(shù)可以真正廣泛應(yīng)用于臨床檢測(cè)。
由于三代測(cè)序的高錯(cuò)誤率和長(zhǎng)度長(zhǎng)特征,目前最適合應(yīng)用于臨床樣品的宏基因組檢測(cè)。

案例分析
案例一  單病種感染


案例二  同一病種多種樣品


案例三  混合感染



案例四  非常規(guī)檢測(cè)病原感染


應(yīng)用展望

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