畜牧人

標(biāo)題: 研究：全基因組從頭測序方法為豬遺傳育種提供了基礎(chǔ) [打印本頁]
作者: zyx595186976    時間: 2016-9-28 10:44
標(biāo)題: 研究：全基因組從頭測序方法為豬遺傳育種提供了基礎(chǔ)
　　日前，四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動物遺傳育種研究所和重慶畜科院、北京諾和致源等單位的研究人員合作，通過全基因組從頭測序方法對豬基因組變異進(jìn)行了全面分析。

　　該研究從頭組裝了歐亞大陸9個代表性豬種(長白豬、大白豬、漢普夏豬、皮特蘭豬、巴克夏豬、梅山豬、榮昌豬、民豬、八眉豬、金華豬)的基因組序列。通過與參考基因組進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)鑒定了大量新的SNP和結(jié)構(gòu)變異。為豬參考基因組補充了137Mb的序列，完整組裝出1737個參考基因組中缺失的蛋白編碼基因，其中74個參與肌肉生長和脂肪沉積，76個參與免疫調(diào)控。

　　基于群體基因組重測序數(shù)據(jù)，鑒定出α蛋白激酶3基因(ALPK3)兩個緊密連鎖的錯義堿基突變(T-G和G-C)將導(dǎo)致蛋白相應(yīng)位置氨基酸(天冬酰胺—組氨酸，絲氨酸—半胱氨酸)的突變，或許與家豬具有較強的沉脂能力相關(guān);多囊腎1樣蛋白2基因(PKD1L2)的錯義堿基突變(C-T)將導(dǎo)致蛋白相應(yīng)位置氨基酸(蘇氨酸—異亮氨酸)的突變，或許與家豬退化的運動能力和重要肉質(zhì)性狀(肌內(nèi)脂肪含量)相關(guān)。

　　這項研究展示了全基因組從頭測序策略在變異檢測應(yīng)用中的巨大優(yōu)勢，為個體基因組測序的變異檢測提供了新實例和新思路，同時也為豬遺傳育種研究提供了寶貴的基礎(chǔ)資源，有力推動了豬在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和生物醫(yī)學(xué)研究中的進(jìn)一步應(yīng)用。





歡迎光臨 畜牧人 (http://m.livemosquitofree.com/) Powered by Discuz! X3.5