家雞是表型多樣性最為豐富的鳥類,是研究復(fù)雜性狀進(jìn)化的極佳動物模型。藏雞是一種分布于青藏高原的古老雞種,經(jīng)過長期的自然選擇和人工選擇作用,對青藏高原特殊環(huán)境表現(xiàn)出很強(qiáng)的適應(yīng)性。例如藏雞血液中紅細(xì)胞數(shù)目顯著多于平原雞,藏雞的血紅蛋白和氧氣的結(jié)合效率較高。
此外其它家雞品種在高原低氧情況下的孵化率遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于藏雞,這也是制約西藏禽業(yè)發(fā)展的重要因素。但是目前對藏雞的高原適應(yīng)性進(jìn)化的遺傳機(jī)制研究甚少。
中國科學(xué)院昆明動物研究所張亞平課題組從頭組裝了一個藏雞基因組,并對5只紅原雞和其他27只不同地區(qū)的家雞進(jìn)行了基因組重測序,通過整合比較基因組學(xué)和群體基因組學(xué)手段來揭示藏雞的高原適應(yīng)性進(jìn)化的遺傳機(jī)制。分析結(jié)果顯示藏雞分成兩個群體,兩個群體之間沒有基因交流,推斷這兩枝藏雞可能分別來自兩個獨(dú)立的世系。隨后分別對兩枝藏雞群體進(jìn)行群體歷史模擬和選擇信號檢測,發(fā)現(xiàn)兩個群體中受到選擇作用的基因在鈣離子信號通路中出現(xiàn)富集,說明鈣離子通路在藏雞的高原適應(yīng)中有著重要的作用。該研究在基因組水平對藏雞品種資源進(jìn)行了初步的評估,揭示了藏雞高原適應(yīng)的潛在遺傳機(jī)制,對藏雞品種資源的保護(hù)和培育均具有理論指導(dǎo)意義。
該研究成果在線發(fā)表于Molecular Biology and Evolution。王明山、李艷以及彭旻晟為共同第一作者,張亞平和吳東東為共同通訊作者。該工作得到中國科學(xué)院先導(dǎo)專項(xiàng)的支持。
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